一分子リアルタイムDNAシークエンサーPacBio® Sequel IIe システム
Sequel IIe システム
- 信頼性の高いハイスループットシークエンシングデータを生成
- HiFiリードへの直接アクセスを提供
- 迅速な成果のために、プロジェクト期間を短縮
- シークエンシングをより安価に提供
- 幅広いSMRT®シークエンシングアプリケーションをサポート
SMRT®シークエンスの強み
ロングリード
数十キロベースのリードにより、完全なゲノムのアセンブルや全長転写産物の配列決定が容易
高い精度
システマティックエラーの無いシークエンシングにより、99.999%以上のコンセンサス精度を達成
均一なカバレッジ
GC含量によるバイアスがないため、他のテクノロジーではアクセスできない領域でも配列決定が可能
1分子の解像度
ネイティブなDNAや、RNA由来のcDNA分子から配列データを取得することで、99.9%以上の1分子精度の高精度ロングリードを実現
エピジェネティクス
シークエンス時にCpGサイトの5mCを検出
PacBio®のソリューション
実績ある技術をベースにしたPacBio®システムは、お客様が期待する優れた結果を提供します。
SMRT® 消耗品
充実した消耗品のセットは、お客様のプロジェクトに合わせてシークエンシングのカスタマイズが可能
SMRT Cell 8Mには800万個のZMWがあり、圧倒的なシークエンシングパワー
SMRT® ソフトウェア
解析ソフトウェアツールは、ランデザインから解析まで、すべてのステップをサポート
信頼できるシークエンシングデータ
長いリード長
HiFiリードは、最大25kbの長いリード長を提供
SMRTbell® Expressテンプレート調製キット2.0と Sequel IIe システム（2.0ケミストリー, Sequel IIeシステムソフトウェアv10, 30時間ムービー）を用いて15kbサイズセレクションしたヒトライブラリのデータ
高い精度
HiFiリードの精度は、中央値で99.9%(Q30)以上と高精度
SMRTbell® Expressテンプレート調製キット2.0と Sequel IIe システム（2.0ケミストリー, Sequel IIeシステムソフトウェアv10, 30時間ムービー）を用いて15kbサイズセレクションしたヒトライブラリのデータ
包括的な変異検出
HiFiリードのみが、すべての種類の変異を低いエラー率で検出
Genome in a Bottleベンチマークに対する変異のコールパフォーマンス: PacBio® HiFi リード（35カバレッジ、Sequel II システム、2.0ケミストリー）、Illumina（35カバレッジ、NovaSeq）、Oxford Nanopore（60カバレッジ、PromethION R9.4.1）
均一なカバレッジ
HiFiリードは増幅無しで生成され、GC含量に基づくバイアス無し
ヒトのサンプルのGCウィンドウごとの平均カバレッジ。20 kb HiFiライブラリ（2.0ケミストリー、Sequel IIシステム）で作成したデータ
SMRT®シークエンシングのアプリケーション
ゲノム、トランスクリプトーム、エピゲノムの包括的な視点を得ることができます。
全ゲノムシークエンシング
完全なリファレンス品質ゲノムの配列の決定とアセンブル、およびハプロタイプのフェージング
変異検出
1塩基変異、インデル、構造変異など、すべての変異を高い精度と再現性でコール
RNAシークエンシング
アセンブル不要の全長転写産物のダイレクトシークエンシングによるアイソフォームの特性の評価
ターゲットシークエンシング
ゲノムの最も困難な領域における変異にも注目
複雑な集団
ヘテロジニアスなミックス中の密接に関連した配列を解明
エピジェネティクス
シークエンシング中にDNAの修飾を直接検出
メガベースサイズのコンティグをアセンブルして、ほぼ完全なヒトの1番染色体に
HiFiリードをハプロタイプにフェージングし、ホモ接合の挿入イベントと複数の1塩基変異を確認
Iso-Seq™ 法で生成した全長転写産物から、複雑な代替スプライシングを確認
装置構成・ソフトウェア
Sequel IIeシステム
| 対応SMRT Cell | SMRT Cell 8M |
|---|---|
| 精度99%以上のHiFiリード数 | 最大4,000,000※ |
| ベースコール | 本体内蔵サーバーで実施 |
| HiFiリードデータ | 本体内蔵サーバーで生成 |
※HiFiリード数はインサートサイズとサンプルクオリティにより変動します
全ての研究者に提供されるデータ解析ツール
- SMRT® Link：直観的に扱えるGUIをお試しください。コマンドラインによる解析も可能です。
- PacBio® DevNet：SMRT®シークエンスのために開発された各種コミュニティツールをご紹介します。
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