Iso-Seqを基礎から学ぼう!
完全長転写物アイソフォームシーケンスで新発見を
開催日: 2022年1月19日(水)〜21日(金)
日時:
2022年 1月19日 : 09:00-13:00 (日本時間)
2022年 1月20日 : 09:00-13:00 (日本時間)
2022年 1月21日 : 09:00-12:30 (日本時間)
参加費:無料
使用言語:英語または日本語
かずさDNA研究所(KDRI)様とPacBio社共同で、Iso-Seqに関する情報解析とそのハンズオンを中心とした3日間のワークショップを開催いたします。
本ワークショップでは、Iso-Seq解析のエキスパートであるPacBio主席研究員のElizabeth Tseng博士、かずさDNA研究所の白澤健太ゲノムユニット長、モントレーベイ水族館研究所(MBARI)研究員のDarrin Schultz博士、PacBioバイオインフォマティシャンのKhi Pin Chua博士を講師に迎え、講義と実習を交えながら、Iso-Seqによる完全長転写産物のアイソフォームシーケンスの可能性について解説します。
参加者は、Iso-Seq実験の全体像を把握するとともに、この高品質な完全長RNAシーケンスデータのいくつかのアプリケーションについて学習したのち、実験デザイン、コスト感、データ生成、解析についても触れることが可能です。演習では、提供されたデータセットを用いて、コンピュートクラスター上でコマンドラインを使用して行います。
本ワークショップでは以下の内容をカバーします:
- Iso-Seq手法の紹介
- SQANTI3によるアイソフォームの分類とアノテーション
- tappASによるアイソフォームの発現差異解析
- 代替スプライシングと疾患の定量化
- シングルセル解析、バリアントコーリング、解析のフレームワーク
- Iso-Seq手法のさらなる展開について
ご参加登録はこちら ※満員御礼※ 定員に達したため登録を終了しております。