近接ライゲーションテクノロジーDovetail Genomics®
Dovetail®の製品とサービス
ゲノムアセンブリ受託サービス
近接ライゲーションを用いた染色体レベルのゲノムアセンブリ受託サービス
サンプルを送付するだけで、近接ライゲーションとゲノムアセンブリのプロフェッショナルであるDovetail Genomics® が最新の設備で、染色体レベルのゲノムアセンブリを作成します。陸上/海洋動物、昆虫、植物など、これまでに1,800件を超えるゲノムアセンブリの実施経験があります。
Dovetail® Omni-C® キット
制限酵素サイトに依存しない完全なHi-C
近接ライゲーションアッセイにおけるクロマチンの断片化にエンドヌクレアーゼを用いることで、従来のHi-Cのように制限酵素サイトに依存することなく、ゲノム全体にわたって均一なカバレッジを得ることができる最新のHi-Cキットです。プロトコルは、ほ乳類細胞、組織、血液、昆虫、植物、海洋動物など、幅広いサンプルタイプで検証済みです。
Dovetail® Micro-C 受託サービス/キット
ヌクレオソームとHi-Cの同時キャプチャ
近接ライゲーションアッセイにおけるクロマチンの断片化にMicrococcal Nuclease (MNase) を用いることで、高解像度なクロマチンコンタクト情報とヌクレオソームの位置情報を同時に捕捉することができるアッセイです。
受託サービスでは、ほ乳類の細胞・組織サンプルを送付するだけで、ライブラリ調製からシークエンス、データ解析、レポート納品までをトータルで実施いたします。TADsまたはLoopsの目的ターゲットに応じて最適なプロジェクトをご用意しています。
Dovetail® HiChIP MNase 受託サービス/キット
ChIP-seqとHi-C の同時キャプチャ
MNaseを用いた近接ライゲーションに、クロマチン免疫沈降(ChIP)による目的DNA結合因子のエンリッチを組み合わせたアッセイです。
キットではIgG, CTCF, H3K4ac, H3K4me3, H3K14ac, H3K27ac, H3K27me3, H3K36me3, PolII, Klf4, Nanog, Oct4, Sox2が検証済みです。
受託サービスでは、ヒト・マウスの細胞・組織サンプルを送付するだけで、ライブラリ調製からシークエンス、データ解析、レポート納品までをトータルで実施いたします。抗体はCTCF, H3K4me3, H3K27acから選択できます。
Dovetail® Targeted Enrichment キット
Dovetail Human/Mouse Promoter Enrichment Kit
ヒトの84,000以上のプロモーター配列、または、マウスの47,000以上のプロモーター配列をターゲットとしたエンリッチメントパネルです。Dovetail® Micro-CまたはOmni-C® kitと組み合わせることで、プロモーター-エンハンサーやプロモーター-プロモーターコンタクトなどのプロモーター特異的な相互作用を高解像度に、かつ低シークエンスコストにて解析することが可能です。
目的別アッセイの選択
Dovetail®アッセイ | Omni-C | Micro-C | HiChIP |
---|---|---|---|
ゲノムトポロジー | ● | ○ | |
ゲノムスキャフォルディング | ● | ||
大規模構造変異 | ● | ||
ジェノタイプ | ● | ||
ハプロタイプ | ● | ||
エンハンサープロモータ インタラクション | ○ | ○ | ● |
タンパク質指向型クロマチン構造 | ● | ||
ハイブリッドキャプチャの使用 | YES | YES |
●:Best fit ○:Good fit
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